Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM136Q6ZRR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms