Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms