Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD1Q6UWL2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD1Q6UWL2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms