Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms