Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40BQ6NWY9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40BQ6NWY9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms