Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms