Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4GALNT3Q6L9W6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4GALNT3Q6L9W6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B4GALNT3Q6L9W6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms