Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP9Q5VTM2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms