Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXDC1Q5TGL8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms