Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1TD1Q5T7N2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1TD1Q5T7N2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms