Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCID2Q5JVF3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCID2Q5JVF3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms