Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12AQ5D1E8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZC3H12AQ5D1E8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms