Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf116Q5BN46 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms