Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF2Q5BJF6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ODF2Q5BJF6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms