Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms