Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC142Q17RM4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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