Protein–RNA interactions for Protein: Q17R89

ARHGAP44, Rho GTPase-activating protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP44Q17R89 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP44Q17R89 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP44Q17R89 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms