Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF239Q16600 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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