Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNCBQ16143 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNCBQ16143 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNCBQ16143 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNCBQ16143 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNCBQ16143 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNCBQ16143 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNCBQ16143 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNCBQ16143 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNCBQ16143 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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