Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ETFDHQ16134 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ETFDHQ16134 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms