Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms