Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RAB39AQ14964 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RAB39AQ14964 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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RAB39AQ14964 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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RAB39AQ14964 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB39AQ14964 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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RAB39AQ14964 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RAB39AQ14964 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB39AQ14964 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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