Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PUM1Q14671 WDR76-203ENST00000452115 813 ntTSL 517.65■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 SEC31A-206ENST00000436790 1717 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 14.4
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PUM1Q14671 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DCUN1D5-207ENST00000529281 1310 ntTSL 216.99■□□□□ 0.314e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.284e-6■■□□□ 14.4
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PUM1Q14671 S100PBP-212ENST00000529027 429 ntTSL 316.6■□□□□ 0.254e-6■■□□□ 14.4
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PUM1Q14671 KHSRP-209ENST00000597704 706 ntTSL 516.41■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 14.4
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PUM1Q14671 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 KHSRP-204ENST00000595112 745 ntTSL 314.81□□□□□ -0.044e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.194e-6■■□□□ 14.4
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PUM1Q14671 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.273e-7■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 SEM1-209ENST00000482389 2773 ntTSL 22.38□□□□□ -2.036e-7■■□□□ 14.4
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PUM1Q14671 TAF1-210ENST00000467309 1313 ntTSL 1 (best)8.97□□□□□ -0.974e-8■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 TAF1-219ENST00000492404 1249 ntTSL 56.93□□□□□ -1.34e-8■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.516e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.066e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 EIF4G1-215ENST00000427607 596 ntTSL 210.35□□□□□ -0.752e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.042e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 317.28■□□□□ 0.362e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 416.04■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.784e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.94e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.974e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.984e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.074e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF2-231ENST00000474312 4687 ntTSL 26.74□□□□□ -1.334e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.414e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.414e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.53□□□□□ -0.244e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 UBXN1-216ENST00000533908 739 ntTSL 1 (best)19.66■□□□□ 0.742e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 UBE2L3-203ENST00000496722 3451 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-9■■□□□ 14.3
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