Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD9Q14511 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms