Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM53BQ14153 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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