Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOFQ13790 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOFQ13790 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOFQ13790 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOFQ13790 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOFQ13790 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOFQ13790 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOFQ13790 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOFQ13790 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOFQ13790 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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