Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTMR3Q13615 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTMR3Q13615 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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