Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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