Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL49Q13405 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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