Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3B2Q13367 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3B2Q13367 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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