Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN13Q12923 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN13Q12923 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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