Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 CDC40YDR364C 1368 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 GRC3YLL035W 1899 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YPL276WYPL276W 438 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 GUP1YGL084C 1683 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 MDN1YLR106C 14733 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YOL153CYOL153C 1746 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 RDI1YDL135C 609 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 VEL1YGL258W 621 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YPL113CYPL113C 1191 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 ROG1YGL144C 2058 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 GUS1YGL245W 2127 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 NUP133YKR082W 3474 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YHL049CYHL049C 816 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 MSN1YOL116W 1149 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YLR001CYLR001C 2589 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 THI20YOL055C 1656 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 SEC18YBR080C 2277 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YIL169CYIL169C 2988 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 CIT1YNR001C 1440 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 TRE1YPL176C 2352 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 RRN11YML043C 1524 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 PDR3YBL005W 2931 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1B-BRQ12193 HEH2YDR458C 1992 nt4.59□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 YPR136CYPR136C 513 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 GUF1YLR289W 1938 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 NUP85YJR042W 2235 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 PPZ1YML016C 2079 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 PEX18YHR160C 852 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 PSK2YOL045W 3306 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 YML037CYML037C 1023 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 ADD37YMR184W 597 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 TUM1YOR251C 915 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 YOR283WYOR283W 693 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 snR43snR43 209 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 XRN1YGL173C 4587 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 YPS6YIR039C 1614 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 RIM21YNL294C 1602 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 GCN5YGR252W 1320 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 SME1YOR159C 285 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 DIB1YPR082C 432 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 DDC1YPL194W 1839 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 RAD26YJR035W 3258 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 DAN4YJR151C 3486 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 ATP5YDR298C 639 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 BIO2YGR286C 1128 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 COX17YLL009C 210 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 BMS1YPL217C 3552 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 SIR1YKR101W 1965 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 RSM24YDR175C 960 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 AIM25YJR100C 984 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 TOM40YMR203W 1164 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 PEX32YBR168W 1242 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 ARO10YDR380W 1908 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 PRP9YDL030W 1593 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 ABD1YBR236C 1311 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 TAF1YGR274C 3201 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 PRP28YDR243C 1767 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 NIS1YNL078W 1224 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 PNG1YPL096W 1092 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 CWH41YGL027C 2502 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 YER084WYER084W 387 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 ERP6YGL002W 651 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 SPT23YKL020C 3249 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 ARO9YHR137W 1542 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1B-BRQ12193 CAX4YGR036C 720 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 CDC11YJR076C 1248 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 MSN2YMR037C 2115 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 PRX1YBL064C 786 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YOR300WYOR300W 309 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 RGC1YPR115W 3252 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 MMR1YLR190W 1476 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 BLM10YFL007W 6432 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YER134CYER134C 537 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 RPS21AYKR057W 264 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 ILS1YBL076C 3219 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 SMC6YLR383W 3345 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YPL109CYPL109C 1974 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 TMA108YIL137C 2841 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 PMS1YNL082W 2622 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 PRS5YOL061W 1491 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 RNR2YJL026W 1200 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YFL040WYFL040W 1623 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 ZDS1YMR273C 2748 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YPK9YOR291W 4419 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 FRE7YOL152W 1863 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YPL150WYPL150W 2706 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 DCS1YLR270W 1053 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YLR297WYLR297W 390 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 DCV1YFR012W 609 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YIL175WYIL175W 318 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 CHA4YLR098C 1947 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 ESF1YDR365C 1887 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 CMR1YDL156W 1569 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 CSM3YMR048W 954 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 GRE1YPL223C 507 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YDL180WYDL180W 1644 nt4.48□□□□□ -1.69
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