Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms