Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD300CQ08708 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms