Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK18Q07002 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms