Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX8Q06710 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms