Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLOD1Q02809 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms