Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNT1Q02742 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms