Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP5P82980 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RBP5P82980 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP5P82980 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP5P82980 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP5P82980 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBP5P82980 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBP5P82980 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms