Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P68104 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms