Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P62891 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P62891 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P62891 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms