Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP46P62068 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP46P62068 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP46P62068 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP46P62068 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP46P62068 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP46P62068 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP46P62068 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP46P62068 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP46P62068 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP46P62068 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms