Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RND3P61587 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RND3P61587 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RND3P61587 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RND3P61587 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RND3P61587 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RND3P61587 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RND3P61587 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RND3P61587 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RND3P61587 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RND3P61587 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RND3P61587 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms