Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TMEM258P61165 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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