Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCD1P59942 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms