Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP12AP54707 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP12AP54707 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms