Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC3P51654 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC3P51654 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC3P51654 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC3P51654 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC3P51654 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC3P51654 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC3P51654 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC3P51654 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC3P51654 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC3P51654 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC3P51654 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms