Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE6CP51160 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE6CP51160 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms