Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSSP48449 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSSP48449 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSSP48449 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSSP48449 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSSP48449 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSSP48449 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSSP48449 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSSP48449 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSSP48449 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LSSP48449 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSSP48449 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSSP48449 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSSP48449 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSSP48449 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSSP48449 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSSP48449 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms