Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX9P48436 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX9P48436 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX9P48436 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX9P48436 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX9P48436 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX9P48436 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX9P48436 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX9P48436 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX9P48436 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX9P48436 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX9P48436 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX9P48436 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX9P48436 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX9P48436 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms